Głównym wyposażeniem Pracowni Projektowania Leków i Nanofarmakologii jest spektrometr mas 1260 seria II/6135XT wraz z modułami do wysokosprawnej chromatografii cieczowej Agilent 1260 Infinity II
Aparatura jest wykorzystywana do analizy nowych związków organicznych otrzymywanych w ramach prowadzonych prac badawczych.